基本修改原則
1.請用追蹤修訂，比較清楚修改地方，提高效率，節省時間。
2.論文的檔名應該加上日期，例如 title_student name_date，不然每次老師都要花時間重新命名，特別是第一學期專題討論，每個學生的檔案標題都是專題討論，改到老師覺得像是學生的助理。
2013年12月1日 星期日
2013年11月30日 星期六
2013年11月20日 星期三
ICCAT, 會議第二天, 暖身賽開始~~~
第二天
談物種管理
首席科學家報告科學評估結果
說是資料不夠
不確定性太高
需要科學研究
大力爭取研究經費與人力
而非洲國家砲火依然猛烈
質疑科學會議不透明
(暗指都是已開發國家主導)
質疑科學家不食人間煙火
評估結果資源差，明明海上魚捉得多
或者反過來
不然就是評估說資源已經復甦，漁民卻在海上捕不到過去那麼多的魚
國際角力，本來就不容易啊!
立場有時候也要跟著議題變
不捕魚的時候，放聲說要資源保育，應該降低總容許捕撈量(TAC)
捕魚的國家，抱怨TAC不夠分，沒有照顧沿海開發中國家的社會經濟
談物種管理
首席科學家報告科學評估結果
說是資料不夠
不確定性太高
需要科學研究
大力爭取研究經費與人力
而非洲國家砲火依然猛烈
質疑科學會議不透明
(暗指都是已開發國家主導)
質疑科學家不食人間煙火
評估結果資源差，明明海上魚捉得多
或者反過來
不然就是評估說資源已經復甦，漁民卻在海上捕不到過去那麼多的魚
國際角力，本來就不容易啊!
立場有時候也要跟著議題變
不捕魚的時候，放聲說要資源保育，應該降低總容許捕撈量(TAC)
捕魚的國家，抱怨TAC不夠分，沒有照顧沿海開發中國家的社會經濟
怕是遠洋開發國家會不會節節敗退呢~~~~
2013年11月19日 星期二
開普敦，ICCAT，2013，非洲國家的轉變
七年前，在一個風雨飄搖的新年前夕，
到南非開普敦待了兩個星期
心裡想，應該以後不會再來了
心裡喜歡他們的鈔票
多有動物系的感覺
於是換了一套做紀念
只是沒想到，這回又算錯了!
2013年11月12日 星期二
2013年11月8日 星期五
2013 兩岸島嶼永續論壇在廈門
2013. 11. 07 來到廈門參加第三屆的兩岸島嶼永續論壇，
這是本所跟廈門大學海洋與海岸管理學院的聯合論壇，
給學生上台報告與交流的機會
開幕式，此次特別請到兩校副校長出席
這次地點在特別的古琴院，以前可沒在琴院開過研討會，
桌上一個洞，據說是放古琴用的。
第一堂的主持人，劉光明教授跟蔡名剛教授
第二堂主持人，李健全教授與薛雄志院長
以下是本研究室的美女帥哥報告，這時候就該知道報告時候要看著觀眾，
不然就只能照到背影!
不然就只能照到背影!
海資所幾乎全員出動，從所長、教授到各年級研究生
更特別的是下午的海韻合唱團表演，從科學面轉到文化面
看所長唱的多認真!
指揮的聲樂老師獨唱起望春風跟燕子，繞樑三日
對岸的古琴大師也是一絕
優秀學生領獎
對於與會者，想必都是難忘的經驗!
2013年11月5日 星期二
全球海洋健康指數給臺灣的啟示
- 全球海洋健康指數給臺灣的啟示[自由時報]20131104
- 黃向文（國立臺灣海洋大學海洋事務與資源管理研究所副教授）
- 莊慶達（國立臺灣海洋大學海洋事務與資源管理研究所副教授教授兼所長、台灣競爭力論壇海洋政策組召集人）
台灣社會盛行各種指數與排名，從幸福到痛苦指數，從大學到暢銷書排名，林林總總，不勝枚舉。但2013年全球海洋健康指數從10月10日公布到現在，竟未見任何報導與討論。這對四面環海，不論民生經濟或國家安全都與海洋息息相關的臺灣，豈非怪事？
臺灣自2000年成立海巡署、2004年成立海洋事務推動委員會、2006年通過海洋政策白皮書，2008馬總統在競選政見中宣示藍色革命、海洋興國，並倡議成立海洋部，到2009年轉而決議成立海洋委員會。這十多年來，臺灣對於海洋環境保護及資源保育的全球性議題，卻始終缺乏通盤性的策略與行動。
為廣泛評估全球人類共同仰賴的廣大海洋其環境的健康狀況，以及對人類糧食安全與經濟貢獻程度，以美國加州大學為首，由全球超過65位海洋領域專家學者所組成的團隊，在多家大型企業及非政府組織、媒體的贊助之下，於2012年首度於自然 (NATURE) 期刊發表「全球海洋健康指數，Ocean Health Index (OHI)」。由於該指數是以「永續」為中心思想，兼顧海洋社會經濟面（海洋糧食供應永續、確保漁業就業機會、海洋經濟與工作、海岸休閒魅力）與環境資源保育面（海洋自然資源永續、儲碳能力、海岸防護力、潔淨海洋、海洋生物多樣性、海洋在地意識）共十項指標，其立場超然，評估詳實，因而獲得聯合國的承認與採納。
該團隊繼2012年評估了171個地區後，於2013年納入許多島嶼週邊海域，將對象擴大為220 個國家／地區。兩次評比中，臺灣海洋的整體健康指數雖從57分微幅提高到59分；但排名卻從171個國家／地區中的第69名，大幅下降到220個國家／地區的第143名。這樣的海洋健康指數，對以海洋國家自我定位的臺灣，到底提供了甚麼警訊？
臺灣排名落後，可能是因為納入一些全球知名度不高的島嶼；且此次排名前十一名都是新增的小島，例如第一名是位於南冰洋的赫德島和麥克唐納群島，也有不少太平洋的島國，因為開發度極低，環境汙染、破壞的程度也相對較低，包括萬那杜從126名提升到16名，吐瓦魯從71名提升到13名。相較於此，雖有少數已開發國家如紐西蘭、挪威等國家維持平盤；但已開發國家排名普遍落後，包括日本從第13名滑落到87名，美國從第27名落到第75名。
臺灣海岸被高度開發利用，加上人口密集，海洋健康程度自難與低度開發的島國相比，因此，我們應該從相對分數所呈現的意義，去思考如何在現有困境下提升臺灣的海洋環境健康。
倘深入從各分項指數檢視臺灣的海洋環境，可以發現臺灣海洋產業經濟的表現仍相當優異，包括確保漁民工作機會方面，排名維持在全球前20名；但在海洋環境保護與資源永續方面，例如特有生物與海域、海岸的保護、海洋休閒魅力以及永續海洋糧食供應部分，都落到了百名之後，顯示在此項目仍有很大的改善空間。即使此次排名唯一提升的潔淨海洋項目，從第143名提升到第103名，也遠遠落後許多國家。當然，資料缺乏或資訊公開度不足，也可能是因素之一。
有關臺灣民眾對海洋的認識，國立臺灣海洋大學海洋事務與資源管理研究所曾於2010年進行臺灣民眾海洋意識調查（該研究近期將發表於Coastal Management國際期刊），發現臺灣民眾會游泳的比例為44%，相對的，也有44%民眾在過去一年內未曾到過海邊（所以臺灣在海洋遊憩方面的分數也不高）；超過七成民眾支持加強對黑鮪、鯊魚等資源的保育，也大多覺得政府在海洋環境保護及資源保育方面做的有限。特別是多數民眾聽過氣候變遷、墨西哥灣油污染事件、海洋保護區等國際海洋相關議題，但卻只有不到一成的民眾知道臺灣有海洋國家公園！
本調查結果顯示，臺灣民眾對於臺灣海洋的認知仍明顯不足。何以致之？或許近來接連發生台菲廣大興漁船槍擊事件，以及台日簽署東海漁業協議，多少增加了民眾對海洋的認識，但政府部門處理海洋事務的機制始終分散在各單位，未能有效統合。一有緊急事件發生，益發突顯海洋議題的複雜度及各部門整合上的困難，更遑論提出更具開創性的海洋戰略。倡議多年的海洋部，以及過渡性角色的海洋委員會，亦因對海洋事務的統整能力及業務涵蓋的範圍與深度仍有爭議，導致該機關組織法遲遲未能通過。
全球海洋健康指數團隊將會持續進行年度評估、更新該指數系統。國立臺灣海洋大學也正積極與該團隊聯繫，並將建立合作機制。然而，台灣海洋健康指數的提升，泰半取決於政府的積極作為。教育部在關切大學排名、經濟部關心經濟成長率、主計處評量國民幸福（痛苦）指數之餘，在全球重視海洋產業與環境健康的大趨勢中，政府部門誰來關心或致力於提升臺灣的海洋健康指數？
2013年10月22日 星期二
2013年10月14日 星期一
APEC 海洋資源保育之圓桌論壇
The 14th APEC Roundtable Meeting
on the involvement of the business/private sector
in the sustainability of the Marine Environment
感謝環保署等單位的"長期"支持以及劉光明老師的細心安排，
讓學生們可以就近見習國際性會議
感受真正的國際事務與外交安排~~
on the involvement of the business/private sector
in the sustainability of the Marine Environment
感謝環保署等單位的"長期"支持以及劉光明老師的細心安排，
讓學生們可以就近見習國際性會議
感受真正的國際事務與外交安排~~
2013年10月13日 星期日
問問題的技巧與說法
研討會的時候，特別是國際研討會是訓練自己問問題的時候
只是，第一次要開口都很困難，以下給幾個參考:
Dear Prof **(name of speaker)
==> 作為開頭，無論如何都要先感謝講者的演說
Thank you for your inspiring talk on shark conservation issues.
Thank you for such a wonderful talk.
Thank you for your interesting presentation.
==>雖然其實 interesting 通常傾向指非傳統的做法，好的方向想是石破天驚的新想法，負面想就是覺得這真是個stupid idea].
Thank you for your informative/comprehensive presentation.
==>informative 可能是指你講得太多了~~~
==> 自我介紹 I am a graduate student from Institute of Marine Affairs and Resources Management, National Taiwan Ocean University,
==>讓人家知道你的背景可以有助講者回答。
要問幾個題目呢? 如果時間有限，儘量問你認為最重要的問題，把其他時間留給別人。
如果時間較多(或者場面較冷)，就可以多問幾個，但會建議可以一次問完，因為倘人多問第二次會問題會比較不禮貌。
問題開頭先點到演講 In your presentation, you mentioned that....
[中間可以簡單提到相關的內容概要，確定彼此的認知沒有落差]
so my questions is,
[清楚開始說你要問問題了，以吸引講者的注意，特別是如果前面講太長]
I was wondering ...................
接下來的問題比較複雜，如果講者聽不懂你的問題? 或者你聽不懂講著的回答?
前者，建議先寫英文稿請人幫忙看，用儘量白話的方式再講一次，而有些時候，主持人(chair, coordinator)會出來幫忙解圍
至於後者，畢竟時間有限，而且可能是彼此程度、認知、乃至於語言的差距，所以，就微笑的感謝講者的回答，
如果這是很重要的問題，則可以嘗試在coffee break 的時候去問，可以有比較充裕的時間詳細解釋或說明。
2013年10月10日 星期四
普天同慶之Sonic成年禮
2013年10月10日
我家Sonic 滿十八歲了
對他說，這表示你已經成年，
以後有事要自己處理
父母可沒辦法每件事都罩你了
老爸不忘記補充，
是阿! 下回把時鐘或玻璃砸爛，還是爬牆，恐怕都沒法去幫妳說情了。
話是這麼說，可事情應該沒有這麼簡單吧!
特別是對這童心未泯，胡裡胡塗的大孩子
不過，上宜大之後
也一天一天看到他的成長與獨立
欣慰之餘，卻也百般不捨
當然，還有十月壽星從二阿姨、小美到小祐，真是光輝十月哪~
我家Sonic 滿十八歲了
對他說，這表示你已經成年，
以後有事要自己處理
父母可沒辦法每件事都罩你了
老爸不忘記補充，
是阿! 下回把時鐘或玻璃砸爛，還是爬牆，恐怕都沒法去幫妳說情了。
話是這麼說，可事情應該沒有這麼簡單吧!
特別是對這童心未泯，胡裡胡塗的大孩子
不過，上宜大之後
也一天一天看到他的成長與獨立
欣慰之餘，卻也百般不捨
當然，還有十月壽星從二阿姨、小美到小祐，真是光輝十月哪~
2013年8月7日 星期三
蛋糕初體驗- 戚風蛋糕 Chiffon Cake
昨兒個看美食節目，看到美味的磅蛋糕
Handsome 說，啥是磅蛋糕
不就是一磅奶油、一磅糖、一磅麵粉加一磅蛋，順口說，明天來試試吧!
今天看完食譜後，一如以往有些猶豫，因為磅蛋糕的奶油比例實在太高，好吃，不過不太健康
Handsome 自己說，還是來做戚風蛋糕吧!
2013年6月30日 星期日
2013年6月26日 星期三
Indonesia tuna fisheries development and future strategy
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0308597X13001255
Rahmadi Sunoko, Hsiang-Wen Huang*, 2014, Indonesia tuna fisheries development and future strategy. Marine Policy.
Rahmadi Sunoko, Hsiang-Wen Huang*, 2014, Indonesia tuna fisheries development and future strategy. Marine Policy.
Highlights
- •
- Bilateral cooperation, joint venture and chartering empowered Indonesia tuna fisheries from 1970s to 1990s.
- •
- ‘Indonesia’ participated fisheries organizations and strengthens domestic managements in 2000s.
- •
- After five stages of development, Indonesian became number one tuna production country in 2004.
- •
- Indonesia needs to build capacity, data collection, and marketing for sustainable tuna fisheries development.
2013年6月22日 星期六
美國環保團體狀告美國州政府又一樁
美國舊金山紅木國家公園Big Basin State Park
為了發展觀光休閒，通過新的開發計畫
可能會威脅到marbled murrelet的生存
於是，環保團體告上法院，要求國家應該採取更積極的保育行動
避免因為觀光威脅到野生物種
2013年6月16日 星期日
檀香山六天三夜戰鬥營
檀香山六天三夜戰鬥營
這次本是公務行程，本來想安排六天五夜較輕鬆的行程
不過事前功課做了很多，也不想在外滯留太久
碰上華航六月直航夏威夷，有六天三夜優惠行程，一人只要29900,
加上之前幫忙訂位的小姐又遲遲未聯絡，就改變主意參加六天三夜
雖則因為單人行，只好改單人房另加一萬元
[四處鼓吹沒人想一道去，簡單說，覺得這麼短的行程，都說太累~~]
於是, 參加完畢典，九日晚十一點飛機飛夏威夷，
九日下午三點抵達，旅行社不免俗的帶你去逛了市政廳後入住旅館，
三晚之後，請自行遊樂到晚間十點送機
搭十三日凌晨一點飛機回台，十四日早上五點半抵達，七點到家，
就這樣，六天三天戰鬥營。
優點是，跟美國科學家三天努力下來完成一篇文章的初稿
所以，到海邊遊憩的時間大概也就是每天走到海邊十分鐘，
拍照，曬太陽，買點紀念品，然後回旅館繼續工作~~~~
首日抵達，時差昏睡中還是要去看一點夏威夷國王雕像~~
不過事前功課做了很多，也不想在外滯留太久
碰上華航六月直航夏威夷，有六天三夜優惠行程，一人只要29900,
加上之前幫忙訂位的小姐又遲遲未聯絡，就改變主意參加六天三夜
雖則因為單人行，只好改單人房另加一萬元
[四處鼓吹沒人想一道去，簡單說，覺得這麼短的行程，都說太累~~]
於是, 參加完畢典，九日晚十一點飛機飛夏威夷，
九日下午三點抵達，旅行社不免俗的帶你去逛了市政廳後入住旅館，
三晚之後，請自行遊樂到晚間十點送機
搭十三日凌晨一點飛機回台，十四日早上五點半抵達，七點到家，
就這樣，六天三天戰鬥營。
優點是，跟美國科學家三天努力下來完成一篇文章的初稿
所以，到海邊遊憩的時間大概也就是每天走到海邊十分鐘，
拍照，曬太陽，買點紀念品，然後回旅館繼續工作~~~~
首日抵達，時差昏睡中還是要去看一點夏威夷國王雕像~~
2013年6月15日 星期六
2013年6月6日 星期四
碩士畢業口試須知Part 1 by Henry
一、 口試申請
1. 線上申請口試開始日期為4/20，至4/30截止(確切時間請查行事曆)，請在開始申請前10天(約4/10)，與老師討論口試委員名單，之後開始聯繫各口試委員，範本如下(請將指導教授列為副本)：
2013年5月25日 星期六
英文摘要的最基本原則
這其實應該是英文作文的原則，例如
1.事實用現在式，研究方法跟結果因為已經做完，所以用過去式或完成式。
2.主詞不是人的，應用被動式。
3.數字少於10者，請用one, two, three, 不要用阿拉伯數字1,2,3.
4.數字在字首，則也用英文而非阿拉伯數字，例如 One hundred questionnaires .....,
1.事實用現在式，研究方法跟結果因為已經做完，所以用過去式或完成式。
2.主詞不是人的，應用被動式。
3.數字少於10者，請用one, two, three, 不要用阿拉伯數字1,2,3.
4.數字在字首，則也用英文而非阿拉伯數字，例如 One hundred questionnaires .....,
2013年5月22日 星期三
Email 禮貌
email禮貌或許個人各有見地，但至少
收到他人信件，當下儘速回復，即使只寫四個字都可以，但不要杳無音訊。
Dear ***
Received with thanks.
Cheers,
***
應該注意卻老是未注意
教書教到第五年，開始會要把這些感想跟事情記下來，
第一件事是
有一些，講過many many many times，
卻總是看到學生用著無辜的眼神看著我
1. 好似從來沒聽過，或者 2. 說知道，可是忘記了
3. 更無辜的會說，老師，我不會~~~
我想，妳們都是二十二歲以上的年輕人了。
第一件事是
有一些，講過many many many times，
卻總是看到學生用著無辜的眼神看著我
1. 好似從來沒聽過，或者 2. 說知道，可是忘記了
3. 更無辜的會說，老師，我不會~~~
我想，妳們都是二十二歲以上的年輕人了。
2013年5月20日 星期一
運用遊客心態打造生態旅遊環境
隨著生態旅遊越來越興盛，也開始有"客製化"生態旅遊的想法，最早有很多研究旅遊動機，例如潛水的動機是因為特有種生物、生物多樣性、生物豐富度、天氣、地質或者與友同遊的心態而參與潛水活動。
也有些以PCA集群分析法分析國家公園的旅客特質，看是喜歡動物生態、植物生態、生物多樣性或者是離群索居的遊客設計不同套裝行程。
此篇則是以choice experiment approach的方式探討到南非國家公園的旅客想法，包括會因為經濟能力(有錢人或非)以及經驗而有不同需求。這些結果都可以做為國家公園管理處管理保育生態系的重點方向。
我們是不是也能用此去分析釣客的心態及種類，去規畫友善的釣魚環境呢？
一樣是研究，如何把成果講得很有價值也是一門學問。
也有些以PCA集群分析法分析國家公園的旅客特質，看是喜歡動物生態、植物生態、生物多樣性或者是離群索居的遊客設計不同套裝行程。
此篇則是以choice experiment approach的方式探討到南非國家公園的旅客想法，包括會因為經濟能力(有錢人或非)以及經驗而有不同需求。這些結果都可以做為國家公園管理處管理保育生態系的重點方向。
我們是不是也能用此去分析釣客的心態及種類，去規畫友善的釣魚環境呢？
一樣是研究，如何把成果講得很有價值也是一門學問。
2013年5月18日 星期六
Gene expression profiling of breast cancer survivability---用21個基因推測乳癌，夠有效率!
Gene expression profiling of breast cancer survivability by pooled cDNA microarray analysis using logistic regression, artificial neural networks and decision trees
Hsiu-Ling Chou1, Chung-Tay Yao2, Sui-Lun Su3, Chia-Yi Lee3, Kuang-Yu Hu4, Harn-Jing Terng5, Yun-Wen Shih3, Yu-Tien Chang3, Yu-Fen Lu3, Chi-Wen Chang6, Mark L Wahlqvist7, Thomas Wetter8 and Chi-Ming Chu3*
BMC Bioinformatics 2013, 14:100 doi:10.1186/1471-2105-14-100
Background
Microarray technology can acquire information about thousands of genes simultaneously. We analyzed published breast cancer microarray databases to predict five-year recurrence and compared the performance of three data mining algorithms of artificial neural networks (ANN), decision trees (DT) and logistic regression (LR) and two composite models of DT-ANN and DT-LR. The collection of microarray datasets from the Gene Expression Omnibus, four breast cancer datasets were pooled for predicting five-year breast cancer relapse. After data compilation, 757 subjects, 5 clinical variables and 13,452 genetic variables were aggregated. The bootstrap method, Mann–Whitney U test and 20-fold cross-validation were performed to investigate candidate genes with 100 most-significant p-values. The predictive powers of DT, LR and ANN models were assessed using accuracy and the area under ROC curve. The associated genes were evaluated using Cox regression.
Results
The DT models exhibited the lowest predictive power and the poorest extrapolation when applied to the test samples. The ANN models displayed the best predictive power and showed the best extrapolation. The 21 most-associated genes, as determined by integration of each model, were analyzed using Cox regression with a 3.53-fold (95% CI: 2.24-5.58) increased risk of breast cancer five-year recurrence…
Conclusions
The 21 selected genes can predict breast cancer recurrence. Among these genes, CCNB1, PLK1 and TOP2A are in the cell cycle G2/M DNA damage checkpoint pathway. Oncologists can offer the genetic information for patients when understanding the gene expression profiles on breast cancer recurrence.
Keywords:
Breast cancer; Microarray; Artificial neural network; Logistic regression; Decision tree
使用資料探勘演算法預測非肺小細胞肺癌患者存活情形及其效能比較
資料越來越多，資料探勘也越來越重要，特別是資訊不足的時候，模式很重要
下面研究三種探勘方法，建議用決策樹決定變項，將變項丟進LOGISTIC MODEL，
不過因為樣本數要夠多，四百多個可能都不太夠，
所以樣本不夠就靠類神經方法可能幫得上忙!
Author: 翁紹宏* 陳麗帆 朱基銘 白璐 楊燦 劉立 孫建安
摘要
本研究使用決策樹、類神經網路和邏輯斯迴歸模型三種資料探勘演算法來探討影響非小細胞肺癌的預後因子及影響模型預測能力的因素（不同資料庫、不同死因、單或複合模型和樣本大小）。本研究的研究對象為美國癌症登記資料檔（the Surveillance, Epidemiology, and End Results, SEER），選取自西元1988年至2004年間診斷為非小細胞肺癌患者，並依據死因的不同將其分為死於肺癌與死於轉移癌;資料經過修整後，共有16個自變項納入分析，並根據其存活情形分為一年、三年和五年存活情形。模型的評估指標為準確率（accuracy, ACC）、ROC曲線下的面積（area under the ROC curve, AUC）和外推力(external generalization)。為避免隨機抽樣造成資料的誤差，本研究將對資料庫進行十折交叉驗證（10-fold cross-validation）。
研究結果顯示，影響美國非小細胞肺癌患者死於肺癌的一年、三年和五年存活情形預後因子為手術種類、臨床分組和腫瘤擴散程度;影響非小細胞肺癌患者死於轉移癌的一年、三年和五年存活情形預後因子為手術種類、臨床分期和檢驗淋巴結個數。
三個模型的預測力表現以類神經網路模型的表現較好，外推能力則以邏輯斯廻歸模型表現較好。樣本人數建議為至少為3500人，其中以邏輯氏回歸模型最容易受到小樣本的影響; 決策樹則是會因為資料庫提供的訊息不足而無法成樹。複合模型的部份，其結果顯示，當決策樹的測試組的ACC值較另外兩個模型好時，則複合模型的測試組AUC值就會提高。
關鍵字：lung cancer, decision tree, artificial neural network, logistic regression, SEER
下面研究三種探勘方法，建議用決策樹決定變項，將變項丟進LOGISTIC MODEL，
不過因為樣本數要夠多，四百多個可能都不太夠，
所以樣本不夠就靠類神經方法可能幫得上忙!
Author: 翁紹宏* 陳麗帆 朱基銘 白璐 楊燦 劉立 孫建安
摘要
本研究使用決策樹、類神經網路和邏輯斯迴歸模型三種資料探勘演算法來探討影響非小細胞肺癌的預後因子及影響模型預測能力的因素（不同資料庫、不同死因、單或複合模型和樣本大小）。本研究的研究對象為美國癌症登記資料檔（the Surveillance, Epidemiology, and End Results, SEER），選取自西元1988年至2004年間診斷為非小細胞肺癌患者，並依據死因的不同將其分為死於肺癌與死於轉移癌;資料經過修整後，共有16個自變項納入分析，並根據其存活情形分為一年、三年和五年存活情形。模型的評估指標為準確率（accuracy, ACC）、ROC曲線下的面積（area under the ROC curve, AUC）和外推力(external generalization)。為避免隨機抽樣造成資料的誤差，本研究將對資料庫進行十折交叉驗證（10-fold cross-validation）。
研究結果顯示，影響美國非小細胞肺癌患者死於肺癌的一年、三年和五年存活情形預後因子為手術種類、臨床分組和腫瘤擴散程度;影響非小細胞肺癌患者死於轉移癌的一年、三年和五年存活情形預後因子為手術種類、臨床分期和檢驗淋巴結個數。
三個模型的預測力表現以類神經網路模型的表現較好，外推能力則以邏輯斯廻歸模型表現較好。樣本人數建議為至少為3500人，其中以邏輯氏回歸模型最容易受到小樣本的影響; 決策樹則是會因為資料庫提供的訊息不足而無法成樹。複合模型的部份，其結果顯示，當決策樹的測試組的ACC值較另外兩個模型好時，則複合模型的測試組AUC值就會提高。
關鍵字：lung cancer, decision tree, artificial neural network, logistic regression, SEER
Statin Use and Reduced Cancer-Related Mortality--標題寫得好!
不是只有台灣有健保資料庫~~~
Statin Use and Reduced Cancer-Related Mortality
Sune F. Nielsen, Ph.D., Børge G. Nordestgaard, M.D., D.M.Sc., and Stig E. Bojesen, M.D., Ph.D., D.M.Sc.
N Engl J Med 2012; 367:1792-1802November 8, 2012DOI: 10.1056/NEJMoa1201735
BACKGROUND
A reduction in the availability of cholesterol may limit the cellular proliferation required for cancer growth and metastasis. We tested the hypothesis that statin use begun before a cancer diagnosis is associated with reduced cancer-related mortality.
METHODS
We assessed mortality among patients from the entire Danish population who had received a diagnosis of cancer between 1995 and 2007, with follow-up until December 31, 2009. Among patients 40 years of age or older, 18,721 had used statins regularly before the cancer diagnosis and 277,204 had never used statins.
RESULTS
Multivariable-adjusted hazard ratios for statin users, as compared with patients who had never used statins, were 0.85 (95% confidence interval [CI], 0.83 to 0.87) for death from any cause and 0.85 (95% CI, 0.82 to 0.87) for death from cancer. Adjusted hazard ratios for death from any cause according to the defined daily statin dose (the assumed average maintenance dose per day) were 0.82 (95% CI, 0.81 to 0.85) for a dose of 0.01 to 0.75 defined daily dose per day, 0.87 (95% CI, 0.83 to 0.89) for 0.76 to 1.50 defined daily dose per day, and 0.87 (95% CI, 0.81 to 0.91) for higher than 1.50 defined daily dose per day; the corresponding hazard ratios for death from cancer were 0.83 (95% CI, 0.81 to 0.86), 0.87 (95% CI, 0.83 to 0.91), and 0.87 (95% CI, 0.81 to 0.92). The reduced cancer-related mortality among statin users as compared with those who had never used statins was observed for each of 13 cancer types.
CONCLUSIONS
Statin use in patients with cancer is associated with reduced cancer-related mortality. This suggests a need for trials of statins in patients with cancer.
2013年5月17日 星期五
A Conference Just in Time
A conference just in time
多年前當大學生，喜歡在實驗課之後晃到思亮館去聽研討會
我們總是開玩笑說，最少有機會去吃吃COFFEE BREAK的高級餐點
多年過去，對於COFFEE BREAK越來越挑，卻還是喜歡參加研討會
聽來自不同領域的聲音與想法，
算一天下來只聽到幾句令人心動的話
或者比比人家的簡報技巧，都是收穫，
就像今天這場2013 ILA-ASOL ASIA-PACIFIC RESEARCH FORUM
International law and dispute resolution: challenges in the Asia Pacific
[2013年國際法學會亞洲研究論壇- 亞太地區挑戰: 國際法與爭端解決]
來自日本美國越南台灣中國的國際法學者熱烈討論東海南海的問題
大概在其他地方很難有這麼多國家專家能平和的坐在一起討論這些問題
雖然偶爾聞到些許煙硝味
安排豐富的圓桌論壇，還有同步翻譯，口譯者技術高超獨撐全場!
主持人是陳長文律師，果然步調沉穩，有大師風範~
左邊惟一的女性則來自日本，她也說道，日本認為釣魚台是沒有主權爭議的地方
每每覺得，其實政府官員更該靜下心來聽幾場
(或者派人認真聽幾場也可以)，
也許對未來施政能更有願景，更有方向，更說得出所以然
[不管聽眾是小學生還是大專家，大家都喜歡圖片繽紛的簡報檔
只是看到連國際學者都有些採用WIKI的圖片檔時
就開始猶豫到底要不要跟學生說不要隨便引用WIKI的資訊了!]
不過，還是跟往常一樣，
首領帶著大批隨扈，發表完開幕詞就走了~~~~
於是，仍就是言者諄諄，聽者藐藐，實在可惜了~~
再說，在晶華酒店開會很花錢的，結果只喝了一杯咖啡!!!
還有就是，英文再好也請不要賣弄，
美國來的講者溫文的慢慢講，讓與會者能夠清楚了解
反倒是有些臺灣人，不是因為覺得英文不好，就越講越小聲，
就是英文太好，怕人家覺得他英文不夠好，說起話跟連珠炮般不休息，
這樣，對於在場的日本、越南等其他非英語系國的人，其實是不禮貌的。
2013年5月16日 星期四
誰能解讀中國的遠洋漁業?
幾年前看過外國人寫有關台灣遠洋漁業的文章，不過就是找年報資料開始拼湊，嘗試了解臺灣，總不免有些誤解或偏見出現。最近幾年，臺灣自己學者寫的文章多了，此類情況就少得多。
相對的，還是有人對中國有興趣，第一篇文章是2001年代Pauly 等人大膽揭露中國大陸高報沿近海漁業產量。此舉讓中國一度不願意提報漁獲量給FAO、繼而展開漁獲量調查，後來宣稱此虛報狀況已經有效改善。
第二篇Marine Policy文章在度嘗試用各種資訊了解中國遠洋漁業與非洲的漁業合作關係，當然不免用現有統計資料推測(穿鑿附會)一番。
第三篇Fish and Fisheries的文章，則是Pauly等人捲土重來，認為中國大陸低報遠洋漁業產量。
但不知這高報與低報之間，到底中國的總產量、乃至全球的總產量是高是低呢？
說真的，漁業的不確定性太高，比天氣還難預測的多，這些推估能有多準呢？科學家們心裡也有數，特別是參加過很多科學會議之後，發現許多科學其實也參雜政治色彩，就當是成就一篇篇PAPER吧!
Reg Watson & Daniel Pauly, 2001, Systematic distortions in world fisheries catch trends, Nature 414, 534-536 | doi:10.1038/35107050
Over 75% of the world marine fisheries catch (over 80 million tonnes per year) is sold on international markets, in contrast to other food commodities (such as rice). At present, only one institution, the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) maintains global fisheries statistics. As an intergovernmental organization, however, FAO must generally rely on the statistics provided by member countries, even if it is doubtful that these correspond to reality. Here we show that misreporting by countries with large fisheries, combined with the large and widely fluctuating catch of species such as the Peruvian anchoveta, can cause globally spurious trends. Such trends influence unwise investment decisions by firms in the fishing sector and by banks, and prevent the effective management of international fisheries.
Mallory, T. G. (2013). China's distant water fishing industry: Evolving policies and implications. Marine Policy, 38(0), 99-108. doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.marpol.2012.05.024
Abstract
This article examines China's distant water fishing industry, with a focus on China's bilateral fisheries access agreements in Africa. The article argues that China largely conforms to international norms and rules on sustainable fisheries, but that challenges remain in efforts to work with China on the sustainable management of fish stocks. Developed countries contribute to China's policies and behavior in international fisheries in both positive and negative ways.
Pauly, D., D. Belhabib, R. Blomeyer, W. W. W. L. Cheung, A. M. Cisneros-Montemayor, D. Copeland, S. Harper, V. W. Y. Lam, Y. Mai, F. Le Manach, H. Österblom, K. M. Mok, L. van der Meer, A. Sanz, S. Shon, U. R. Sumaila, W. Swartz, R. Watson, Y. Zhai, and D. Zeller. 2013. China's distant-water fisheries in the 21st century. Fish and Fisheries: doi: 10.1111/faf.12032.
We conservatively estimate the distant-water fleet catch of the People's Republic of China for 2000–2011, using a newly assembled database of reported occurrence of Chinese fishing vessels in various parts of the world and information on the annual catch by vessel type. Given the unreliability of official statistics, uncertainty of results was estimated through a regionally stratified Monte Carlo approach, which documents the presence and number of Chinese vessels in Exclusive Economic Zones and then multiplies these by the expected annual catch per vessel. We find that China, which over-reports its domestic catch, substantially under-reports the catch of its distant-water fleets. This catch, estimated at 4.6 million t year−1 (95% central distribution, 3.4–6.1 million t year−1) from 2000 to 2011 (compared with an average of 368 000 t·year−1 reported by China to FAO), corresponds to an ex-vessel landed value of 8.93 billion € year−1 (95% central distribution, 6.3–12.3 billion). Chinese distant-water fleets extract the largest catch in African waters (3.1 million t year−1, 95% central distribution, 2.0–4.4 million t), followed by Asia (1.0 million t year−1, 0.56–1.5 million t), Oceania (198 000 t year−1, 144 000–262 000 t), Central and South America (182 000 t year−1, 94 000–299 000 t) and Antarctica (48 000 t year−1, 8 000–129 000 t). The uncertainty of these estimates is relatively high, but several sources of inaccuracy could not be fully resolved given the constraints inherent in the underlying data and method, which also prevented us from distinguishing between legal and illegal catch.
2013年5月15日 星期三
已開發與開發中國家漁業合作的爭論~~
Gagern, A. and J. van den Bergh (2013). "A critical review of fishing agreements with tropical developing countries." Marine Policy 38(0): 375-386.
心得
-從魚線的盡頭開始，就有不少聲音質疑雙邊漁業合作的模式，美其名能夠充分利用海洋資源、也提供開發中國家經濟資助。
-此篇文章作者(來自歐洲西班牙等國的環保團體)認為許多漁業協定中的遠洋漁業國家已經越來越不負責任(這是在說誰呢)，對於資源傷害日增，而沿岸國受益有限!
-這些文章裡面多少會提到台灣，但因為資訊不充分，往往顯得片段
==>我們真的應該好好寫篇有關台灣遠洋漁業雙邊多邊合作的"貢獻"~
Abstract
Many African, Caribbean and Pacific (ACP) countries sell fishing licenses to distant water fleets. Fishing agreements have the potential to improve the performance of local fishing sectors. They create income that can be reinvested into domestic industries and often go along with partnerships in management and enforcement. However, many fishing agreements run a serious risk of undermining sustainable resource management. The present study critically reviews trends in distant water fishing as well as identifies those tropical host countries most dependent on fishing agreements. It is shown that traditional, more responsible distant water fleets (DWFs) are being displaced by less responsible, low-cost DWFs and that the most vulnerable host countries are small coastal states with large exclusive economic zones that lack the ability to benefit from value adding processes associated with fishing. The results suggest that the once-promising concept of fishing agreements is gradually posing a threat to both economic development and environmental sustainability of ACP countries.
心得
-從魚線的盡頭開始，就有不少聲音質疑雙邊漁業合作的模式，美其名能夠充分利用海洋資源、也提供開發中國家經濟資助。
-此篇文章作者(來自歐洲西班牙等國的環保團體)認為許多漁業協定中的遠洋漁業國家已經越來越不負責任(這是在說誰呢)，對於資源傷害日增，而沿岸國受益有限!
-這些文章裡面多少會提到台灣，但因為資訊不充分，往往顯得片段
==>我們真的應該好好寫篇有關台灣遠洋漁業雙邊多邊合作的"貢獻"~
Abstract
Many African, Caribbean and Pacific (ACP) countries sell fishing licenses to distant water fleets. Fishing agreements have the potential to improve the performance of local fishing sectors. They create income that can be reinvested into domestic industries and often go along with partnerships in management and enforcement. However, many fishing agreements run a serious risk of undermining sustainable resource management. The present study critically reviews trends in distant water fishing as well as identifies those tropical host countries most dependent on fishing agreements. It is shown that traditional, more responsible distant water fleets (DWFs) are being displaced by less responsible, low-cost DWFs and that the most vulnerable host countries are small coastal states with large exclusive economic zones that lack the ability to benefit from value adding processes associated with fishing. The results suggest that the once-promising concept of fishing agreements is gradually posing a threat to both economic development and environmental sustainability of ACP countries.
Havice, E. and K. Reed (2012). "Fishing for Development? Tuna Resource Access and Industrial Change in Papua New Guinea." Journal of Agrarian Change 12(2-3): 413-435.
心得
PNG(巴布亞紐新幾內亞，業者又稱之巴新，可不是巴西)，是在國內"赫赫有名"的太平洋島國，早期台灣圍網船(還有其他國家)付費入漁，彼此各取所需，相安無事。
近來，PNG不再只要"魚"，更想擁有釣竿，這下子開始要求投資罐頭廠、使用當地勞工，於是，重新改寫漁業合作的模式，
未來將如何發展呢？to be continued.
Abstract
Papua New Guinea (PNG) is an island state with sovereign rights over valuable tuna resources. Historically, PNG captured value from tuna only by charging licensing fees to foreign fishing fleets, which relegated PNG as a source of raw material for the global tuna industry. To capture more value from tuna – including much-needed jobs and infrastructure – the PNG government now offers firms that invest in domestic tuna processing plants strategic, long-term fishing licences. This strategy of ‘obligating embeddedness’ enables PNG to reorder the international division of labour in the canned tuna sector, but socio-economic outcomes are shaped by competition within the global tuna industry, the core business strategies of foreign firms and domestic conditions in PNG. Ultimately, a state's right to control the terms of access to tuna is not synonymous with its ability to shape the local-level consequences that emerge as firms comply. These findings reveal the peculiar nature of state sovereignty over pelagic marine resources and the complications of exploiting them to achieve domestic economic and social objectives.
心得
PNG(巴布亞紐新幾內亞，業者又稱之巴新，可不是巴西)，是在國內"赫赫有名"的太平洋島國，早期台灣圍網船(還有其他國家)付費入漁，彼此各取所需，相安無事。
近來，PNG不再只要"魚"，更想擁有釣竿，這下子開始要求投資罐頭廠、使用當地勞工，於是，重新改寫漁業合作的模式，
未來將如何發展呢？to be continued.
Abstract
Papua New Guinea (PNG) is an island state with sovereign rights over valuable tuna resources. Historically, PNG captured value from tuna only by charging licensing fees to foreign fishing fleets, which relegated PNG as a source of raw material for the global tuna industry. To capture more value from tuna – including much-needed jobs and infrastructure – the PNG government now offers firms that invest in domestic tuna processing plants strategic, long-term fishing licences. This strategy of ‘obligating embeddedness’ enables PNG to reorder the international division of labour in the canned tuna sector, but socio-economic outcomes are shaped by competition within the global tuna industry, the core business strategies of foreign firms and domestic conditions in PNG. Ultimately, a state's right to control the terms of access to tuna is not synonymous with its ability to shape the local-level consequences that emerge as firms comply. These findings reveal the peculiar nature of state sovereignty over pelagic marine resources and the complications of exploiting them to achieve domestic economic and social objectives.
新北市可以釣魚的漁港不少
在新北市非開放港區下竿 最高罰15萬
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新北市海岸有30處漁港，市府僅公告開放10處漁港部分港區供垂釣；但許多釣友任意在非開放港區或其他漁港下竿，不但妨害漁船、港區車輛進出，還曾發生甩鉛垂、丟酒瓶擊傷漁民等糾紛。市府農業局已與海巡署、警方組成聯合稽查小組，本月至10月鎖定13座漁港加強稽查違法下竿，若釣友拒絕配合，依漁港法可開罰3萬至15萬元。 新北市農業局自1996年配合漁港法修法，在全市30處漁港擇定淡水第二、後厝、草里、中角、水尾、野柳、深澳、水湳洞、和美及福隆等10處漁港，公告部分不影響漁船進出的港區可下竿港釣。 但不少釣客卻常在10處漁港的非公告港釣區下竿，甚至其餘20處漁港也常見釣客身影，以富基、磺港、澳底最多。尤其魚況佳時，釣客蜂擁而至，車輛在港區亂停，屢生糾紛，以夏季晚間最常見。 萬里區漁會總幹事許順發舉例說，野柳港曾發生港區停滿釣客的車，釣客多到連攤販都趕來作生意，不但造成髒亂，還導致接運紅蟳的水車受阻，無法進碼頭接運，船上紅蟳死了不少，漁民平白損失。 另曾有漁船進港受阻，與堤岸上釣客喊話爭吵時，釣客群裡突然拋出一只酒瓶砸傷漁民，因查不到丟瓶者而不了了之。 他說，漁民熱情好客，不會排斥守規矩的釣客，但不守規矩的釣客讓人深惡痛絕，除了市府加強稽查，也希望釣客自制。 漁管處長汪昭華說，夏季白帶魚、硬尾仔或鯖魚等洄游性魚類追逐小魚進漁港，釣客就會湧入，造成漁民困擾、作業受阻；去年起首度進行聯合稽查，共開出約500張勸導單，今年自本月起再度聯合稽查，每周至少一次。 |
全文網址: 在新北市非開放港區下竿 最高罰15萬 | 大台北 | 地方新聞 | 聯合新聞網 http://udn.com/NEWS/DOMESTIC/DOM2/7895408.shtml#ixzz2TDpVu2ly
2013年5月14日 星期二
韓國海岸廢棄物對於野生動物的衝擊
Reference
Mar Pollut Bull. 2013 Jan 15;66(1-2):117-24. doi: 10.1016/j.marpolbul.2012.10.022. Epub 2012 Nov 28.
Impacts of marine debris on wild animals in the coastal area of Korea.
Source
摘要
韓國也體悟到海洋垃圾對於沿海生態系的衝擊，所以在2010年2月到2012年3月，兩年期間收集資料發現有18種鳥類，2種哺乳動物，甲殼類和1種共21種受到衝擊。其中包括五個威脅或保護物種江豚的黑面琵鷺，大天鵝，獐，和彩鷸。其中發現不少休閒漁具，所以，休閒漁業活動應該列為優先管理重點。
==>這件研究有趣的地方是利用公民科學的方式蒐集資料，也就是教育推廣大眾參與並回報資訊!
Abstract
Over the last decade, marine debris has become a major factor affecting the coastal ecosystem of Korea. This study compiled information regarding how marine debris impacts wildlife in Korea. Cases of marine debris impacting wildlife were collected from experts of various fields and from local participants through an open access website from February 2010 to March 2012. A total of 21 species were affected by marine debris: 18 species of birds, 2 species of mammals, and 1 species of crustacean. Five threatened or protected species were identified: black-faced spoonbill, finless porpoise, water deer, whooper swan, and greater painted snipe. Recreational fishing gears were the types of debris that most frequently impacted wildlife, especially birds. Black tailed gulls were the most vulnerable species to recreational fishing hooks and lines. Although it was preliminary, this study revealed that recreational fishing activities should be prioritized when managing marine debris in Korea.
其他參考文獻
Kruger, L. E., Shannon, M. A. (2000). Getting to know ourselves and our places through participation in civic social assessment, Society and Natural Resources, 13: 461-478
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